全球首个青稞基因组图谱发布

作者:亚博yabo888vip网页版登录发布时间:2022-12-10 01:19

本文摘要:13日,全球首个青稞基因组图谱月绘制顺利,其研究成果在线公开发表在PNAS杂志上。该研究对青稞的西藏地方品种LasaGoumang展开了全基因组测序及图谱绘制,取得了大小为3.89Gb的基因图谱,共计包括36151个蛋白编码基因。据报,这是时隔小麦基因组(A,D)、大麦基因组物理图、国际小麦家族基因组研究工作的又一个里程碑式的变革,给未来麦类作物的改进以及其他高原作物的研究工作获取了宝贵的参考资料。

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13日,全球首个青稞基因组图谱月绘制顺利,其研究成果在线公开发表在PNAS杂志上。该研究对青稞的西藏地方品种LasaGoumang展开了全基因组测序及图谱绘制,取得了大小为3.89Gb的基因图谱,共计包括36151个蛋白编码基因。据报,这是时隔小麦基因组(A,D)、大麦基因组物理图、国际小麦家族基因组研究工作的又一个里程碑式的变革,给未来麦类作物的改进以及其他高原作物的研究工作获取了宝贵的参考资料。

为说明了青稞的高原适应性机制,理解其起源、驯养及栽培育种过程,西藏自治区农牧科学院、西藏自治区大麦和牦牛培育重点实验室、中国科学院、深圳华大基因研究院、华大科技等在内的众多研究单位于2012年月启动了青稞基因组研究合作项目。青稞,在西藏语中称作Ne,在分类学上是一种裸大麦。

和其他大麦有所不同,青稞经过藏族人民长达3500年—4000年的驯养栽培,早已几乎适应环境了极端的高原气候,沦为了藏族人民的主食。据报,西藏地区的青稞栽种面积占到西藏耕地面积的70%。现在,西藏是世界青稞的驯养和多样化品种栽培中心之一。

记者从华大基因理解,该研究使用仅有基因组鸟枪法测序,对西藏的地方品种青稞LasaGoumang展开了全方位理解。据估计,青稞基因组大小大约为4.5Gb,本次研究所建构的青稞基因组图谱大小为3.89Gb,共计占到青稞基因组的87%,包括了36151个蛋白编码基因。随后,研究人员将青稞基因组和其他的禾本科作物基因组展开了核对,结果找到青稞大约于1700万年前从细山羊草(小麦D)、乌拉尔图小麦(小麦A)以及冬小麦中分离出来。

研究人员更进一步分析找到,现代青稞基因组中依然有大量的序列同细山羊草(小麦D),乌拉尔图小麦(小麦A)和短柄二叶草相近,其相近基因家庭数目高达18849个。研究人员又更进一步对青稞的高原适应性和人工自由选择情况展开了研究。

通过对10株野生和栽培青稞品种的轻测序,研究人员找到,野生青稞品种的SNP数目是栽培青稞的2倍,这解释人工育种过程给青稞品种带给了基因瓶颈。


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